Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HACD3Q9P035 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HACD3Q9P035 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HACD3Q9P035 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACD3Q9P035 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACD3Q9P035 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACD3Q9P035 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HACD3Q9P035 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACD3Q9P035 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACD3Q9P035 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACD3Q9P035 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACD3Q9P035 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACD3Q9P035 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACD3Q9P035 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACD3Q9P035 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACD3Q9P035 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACD3Q9P035 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms