Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHMP5Q9NZZ3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
CHMP5Q9NZZ3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHMP5Q9NZZ3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHMP5Q9NZZ3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHMP5Q9NZZ3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHMP5Q9NZZ3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHMP5Q9NZZ3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CHMP5Q9NZZ3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHMP5Q9NZZ3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHMP5Q9NZZ3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHMP5Q9NZZ3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHMP5Q9NZZ3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHMP5Q9NZZ3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHMP5Q9NZZ3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHMP5Q9NZZ3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHMP5Q9NZZ3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHMP5Q9NZZ3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHMP5Q9NZZ3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHMP5Q9NZZ3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHMP5Q9NZZ3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHMP5Q9NZZ3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHMP5Q9NZZ3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHMP5Q9NZZ3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHMP5Q9NZZ3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHMP5Q9NZZ3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHMP5Q9NZZ3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHMP5Q9NZZ3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHMP5Q9NZZ3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMP5Q9NZZ3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMP5Q9NZZ3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMP5Q9NZZ3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMP5Q9NZZ3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMP5Q9NZZ3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMP5Q9NZZ3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMP5Q9NZZ3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMP5Q9NZZ3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMP5Q9NZZ3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMP5Q9NZZ3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMP5Q9NZZ3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMP5Q9NZZ3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHMP5Q9NZZ3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHMP5Q9NZZ3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHMP5Q9NZZ3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CHMP5Q9NZZ3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMP5Q9NZZ3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMP5Q9NZZ3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMP5Q9NZZ3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMP5Q9NZZ3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMP5Q9NZZ3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMP5Q9NZZ3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP5Q9NZZ3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP5Q9NZZ3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP5Q9NZZ3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP5Q9NZZ3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms