Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNK4Q9NYG8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNK4Q9NYG8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNK4Q9NYG8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms