Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.4 ms