Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX57

RAB20, Ras-related protein Rab-20, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20Q9NX57 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAB20Q9NX57 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB20Q9NX57 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB20Q9NX57 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB20Q9NX57 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB20Q9NX57 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB20Q9NX57 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB20Q9NX57 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB20Q9NX57 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB20Q9NX57 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB20Q9NX57 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB20Q9NX57 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB20Q9NX57 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB20Q9NX57 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB20Q9NX57 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB20Q9NX57 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB20Q9NX57 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB20Q9NX57 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB20Q9NX57 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB20Q9NX57 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB20Q9NX57 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB20Q9NX57 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB20Q9NX57 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB20Q9NX57 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB20Q9NX57 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB20Q9NX57 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB20Q9NX57 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB20Q9NX57 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB20Q9NX57 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB20Q9NX57 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB20Q9NX57 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB20Q9NX57 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB20Q9NX57 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB20Q9NX57 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB20Q9NX57 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB20Q9NX57 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB20Q9NX57 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB20Q9NX57 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB20Q9NX57 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB20Q9NX57 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB20Q9NX57 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB20Q9NX57 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB20Q9NX57 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB20Q9NX57 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB20Q9NX57 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB20Q9NX57 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB20Q9NX57 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB20Q9NX57 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB20Q9NX57 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB20Q9NX57 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB20Q9NX57 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB20Q9NX57 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB20Q9NX57 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB20Q9NX57 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RAB20Q9NX57 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RAB20Q9NX57 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB20Q9NX57 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB20Q9NX57 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB20Q9NX57 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB20Q9NX57 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB20Q9NX57 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB20Q9NX57 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB20Q9NX57 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB20Q9NX57 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB20Q9NX57 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB20Q9NX57 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB20Q9NX57 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB20Q9NX57 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB20Q9NX57 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB20Q9NX57 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB20Q9NX57 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms