Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DNAJC28Q9NX36 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAJC28Q9NX36 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms