Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCAF13Q9NV06 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DCAF13Q9NV06 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms