Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPTLC3Q9NUV7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SPTLC3Q9NUV7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPTLC3Q9NUV7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPTLC3Q9NUV7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SPTLC3Q9NUV7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPTLC3Q9NUV7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPTLC3Q9NUV7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPTLC3Q9NUV7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPTLC3Q9NUV7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPTLC3Q9NUV7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPTLC3Q9NUV7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPTLC3Q9NUV7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPTLC3Q9NUV7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPTLC3Q9NUV7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SPTLC3Q9NUV7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPTLC3Q9NUV7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPTLC3Q9NUV7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPTLC3Q9NUV7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPTLC3Q9NUV7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPTLC3Q9NUV7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPTLC3Q9NUV7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPTLC3Q9NUV7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPTLC3Q9NUV7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPTLC3Q9NUV7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPTLC3Q9NUV7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPTLC3Q9NUV7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPTLC3Q9NUV7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPTLC3Q9NUV7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPTLC3Q9NUV7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SPTLC3Q9NUV7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPTLC3Q9NUV7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPTLC3Q9NUV7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPTLC3Q9NUV7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPTLC3Q9NUV7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPTLC3Q9NUV7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SPTLC3Q9NUV7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPTLC3Q9NUV7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPTLC3Q9NUV7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPTLC3Q9NUV7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPTLC3Q9NUV7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms