Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC40.58■■■■■ 4.09
PDS5BQ9NTI5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
PDS5BQ9NTI5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
PDS5BQ9NTI5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
PDS5BQ9NTI5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC40.57■■■■■ 4.08
PDS5BQ9NTI5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
PDS5BQ9NTI5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
PDS5BQ9NTI5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
PDS5BQ9NTI5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
PDS5BQ9NTI5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC40.55■■■■■ 4.08
PDS5BQ9NTI5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
PDS5BQ9NTI5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
PDS5BQ9NTI5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
PDS5BQ9NTI5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
PDS5BQ9NTI5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC40.54■■■■■ 4.08
PDS5BQ9NTI5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
PDS5BQ9NTI5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
PDS5BQ9NTI5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
PDS5BQ9NTI5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
PDS5BQ9NTI5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
PDS5BQ9NTI5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
PDS5BQ9NTI5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
PDS5BQ9NTI5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
PDS5BQ9NTI5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
PDS5BQ9NTI5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
PDS5BQ9NTI5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
PDS5BQ9NTI5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
PDS5BQ9NTI5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
PDS5BQ9NTI5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
PDS5BQ9NTI5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
PDS5BQ9NTI5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
PDS5BQ9NTI5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
PDS5BQ9NTI5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
PDS5BQ9NTI5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
PDS5BQ9NTI5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
PDS5BQ9NTI5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
PDS5BQ9NTI5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.07
PDS5BQ9NTI5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
PDS5BQ9NTI5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
PDS5BQ9NTI5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
PDS5BQ9NTI5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
PDS5BQ9NTI5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.49■■■■■ 4.07
PDS5BQ9NTI5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
PDS5BQ9NTI5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
PDS5BQ9NTI5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
PDS5BQ9NTI5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
PDS5BQ9NTI5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
PDS5BQ9NTI5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
PDS5BQ9NTI5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
PDS5BQ9NTI5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
PDS5BQ9NTI5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
PDS5BQ9NTI5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
PDS5BQ9NTI5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
PDS5BQ9NTI5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
PDS5BQ9NTI5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
PDS5BQ9NTI5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
PDS5BQ9NTI5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
PDS5BQ9NTI5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
PDS5BQ9NTI5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
PDS5BQ9NTI5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
PDS5BQ9NTI5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
PDS5BQ9NTI5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
PDS5BQ9NTI5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
PDS5BQ9NTI5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
PDS5BQ9NTI5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC40.45■■■■■ 4.07
PDS5BQ9NTI5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
PDS5BQ9NTI5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC40.44■■■■■ 4.06
PDS5BQ9NTI5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC40.44■■■■■ 4.06
PDS5BQ9NTI5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
PDS5BQ9NTI5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
PDS5BQ9NTI5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
PDS5BQ9NTI5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
PDS5BQ9NTI5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
PDS5BQ9NTI5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
PDS5BQ9NTI5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
PDS5BQ9NTI5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
PDS5BQ9NTI5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC40.42■■■■■ 4.06
PDS5BQ9NTI5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
PDS5BQ9NTI5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
PDS5BQ9NTI5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
PDS5BQ9NTI5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
PDS5BQ9NTI5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
PDS5BQ9NTI5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
PDS5BQ9NTI5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
PDS5BQ9NTI5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
PDS5BQ9NTI5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
PDS5BQ9NTI5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
PDS5BQ9NTI5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
PDS5BQ9NTI5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC40.38■■■■■ 4.05
PDS5BQ9NTI5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
PDS5BQ9NTI5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
PDS5BQ9NTI5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
PDS5BQ9NTI5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
PDS5BQ9NTI5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
PDS5BQ9NTI5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
PDS5BQ9NTI5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC40.37■■■■■ 4.05
PDS5BQ9NTI5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
PDS5BQ9NTI5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
PDS5BQ9NTI5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
PDS5BQ9NTI5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms