Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP8A2Q9NTI2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP8A2Q9NTI2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP8A2Q9NTI2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP8A2Q9NTI2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP8A2Q9NTI2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP8A2Q9NTI2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP8A2Q9NTI2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP8A2Q9NTI2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP8A2Q9NTI2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP8A2Q9NTI2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP8A2Q9NTI2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP8A2Q9NTI2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP8A2Q9NTI2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP8A2Q9NTI2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP8A2Q9NTI2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP8A2Q9NTI2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP8A2Q9NTI2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP8A2Q9NTI2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP8A2Q9NTI2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP8A2Q9NTI2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP8A2Q9NTI2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP8A2Q9NTI2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP8A2Q9NTI2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP8A2Q9NTI2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP8A2Q9NTI2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP8A2Q9NTI2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP8A2Q9NTI2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP8A2Q9NTI2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP8A2Q9NTI2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP8A2Q9NTI2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP8A2Q9NTI2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP8A2Q9NTI2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP8A2Q9NTI2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP8A2Q9NTI2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP8A2Q9NTI2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP8A2Q9NTI2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP8A2Q9NTI2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP8A2Q9NTI2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP8A2Q9NTI2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP8A2Q9NTI2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP8A2Q9NTI2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP8A2Q9NTI2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP8A2Q9NTI2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP8A2Q9NTI2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP8A2Q9NTI2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP8A2Q9NTI2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP8A2Q9NTI2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP8A2Q9NTI2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP8A2Q9NTI2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP8A2Q9NTI2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP8A2Q9NTI2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP8A2Q9NTI2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ATP8A2Q9NTI2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP8A2Q9NTI2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP8A2Q9NTI2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms