Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC13Q9NSE7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC13Q9NSE7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC13Q9NSE7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC13Q9NSE7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC13Q9NSE7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC13Q9NSE7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC13Q9NSE7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC13Q9NSE7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC13Q9NSE7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC13Q9NSE7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ABCC13Q9NSE7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms