Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SERINC1Q9NRX5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SERINC1Q9NRX5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms