Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
C8orf4Q9NR00 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms