Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT4

EXOSC5, Exosome complex component RRP46, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC5Q9NQT4 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.52e-7■■■■■ 31.9
EXOSC5Q9NQT4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.081e-6■■■■■ 31.9
EXOSC5Q9NQT4 MAP3K20-205ENST00000468408 585 ntTSL 313.54□□□□□ -0.241e-6■■■■■ 31.9
EXOSC5Q9NQT4 MAP3K20-206ENST00000476618 4010 ntTSL 1 (best)8.57□□□□□ -1.041e-6■■■■■ 31.9
EXOSC5Q9NQT4 MAP3K20-201ENST00000338983 7179 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.221e-6■■■■■ 31.9
EXOSC5Q9NQT4 MAP3K20-208ENST00000539448 2312 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.231e-6■■■■■ 31.9
EXOSC5Q9NQT4 MAP3K20-204ENST00000422149 661 ntTSL 46.35□□□□□ -1.391e-6■■■■■ 31.9
EXOSC5Q9NQT4 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.741e-6■■■■■ 31.9
EXOSC5Q9NQT4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.991e-6■■■■■ 31.9
EXOSC5Q9NQT4 EGLN3-208ENST00000551935 575 ntTSL 411.76□□□□□ -0.531e-6■■■■■ 31.9
EXOSC5Q9NQT4 SPATA5-202ENST00000422835 2492 ntTSL 1 (best)8.23□□□□□ -1.091e-6■■■■■ 31.9
EXOSC5Q9NQT4 RAD51B-205ENST00000471583 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.97e-7■■■■■ 31.9
EXOSC5Q9NQT4 RAD51B-208ENST00000479335 1615 ntTSL 1 (best)8.55□□□□□ -1.047e-7■■■■■ 31.9
EXOSC5Q9NQT4 RAD51B-211ENST00000487861 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.37e-7■■■■■ 31.9
EXOSC5Q9NQT4 RAD51B-212ENST00000488612 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.357e-7■■■■■ 31.9
EXOSC5Q9NQT4 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.487e-7■■■■■ 31.9
EXOSC5Q9NQT4 RAD51B-202ENST00000460526 794 ntTSL 35.62□□□□□ -1.517e-7■■■■■ 31.9
EXOSC5Q9NQT4 RAD51B-204ENST00000469165 1158 ntTSL 35.62□□□□□ -1.517e-7■■■■■ 31.9
EXOSC5Q9NQT4 RAD51B-207ENST00000478014 618 ntTSL 35.37□□□□□ -1.557e-7■■■■■ 31.9
EXOSC5Q9NQT4 RAD51B-219ENST00000554244 669 ntTSL 35.17□□□□□ -1.587e-7■■■■■ 31.9
EXOSC5Q9NQT4 RAD51B-216ENST00000553595 795 ntTSL 34.44□□□□□ -1.77e-7■■■■■ 31.9
EXOSC5Q9NQT4 RAD51B-213ENST00000492236 417 ntTSL 33.83□□□□□ -1.87e-7■■■■■ 31.9
EXOSC5Q9NQT4 RAD51B-214ENST00000497460 546 ntTSL 43.27□□□□□ -1.897e-7■■■■■ 31.9
EXOSC5Q9NQT4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.047e-8■■■■■ 31.9
EXOSC5Q9NQT4 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.317e-8■■■■■ 31.9
EXOSC5Q9NQT4 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.297e-8■■■■■ 31.9
EXOSC5Q9NQT4 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.457e-8■■■■■ 31.9
EXOSC5Q9NQT4 MLLT10-208ENST00000438473 1085 ntTSL 54.42□□□□□ -1.77e-8■■■■■ 31.9
EXOSC5Q9NQT4 MLLT10-206ENST00000420525 538 ntTSL 32.57□□□□□ -27e-8■■■■■ 31.9
EXOSC5Q9NQT4 GALK2-208ENST00000559040 471 ntTSL 57.47□□□□□ -1.212e-7■■■■■ 31.9
EXOSC5Q9NQT4 MED13-206ENST00000583958 1068 ntTSL 1 (best)4.94□□□□□ -1.627e-7■■■■■ 31.8
EXOSC5Q9NQT4 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.667e-7■■■■■ 31.8
EXOSC5Q9NQT4 SPC25-204ENST00000479309 510 ntTSL 52.54□□□□□ -21e-6■■■■■ 31.8
EXOSC5Q9NQT4 PRIM2-205ENST00000490313 410 ntTSL 34.51□□□□□ -1.696e-7■■■■■ 31.8
EXOSC5Q9NQT4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.443e-7■■■■■ 31.8
EXOSC5Q9NQT4 EHBP1-204ENST00000405482 1311 ntTSL 217.68■□□□□ 0.423e-7■■■■■ 31.8
EXOSC5Q9NQT4 EHBP1-201ENST00000263991 5165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -13e-7■■■■■ 31.8
EXOSC5Q9NQT4 EHBP1-205ENST00000413434 533 ntTSL 48.48□□□□□ -1.053e-7■■■■■ 31.8
EXOSC5Q9NQT4 EHBP1-217ENST00000472809 1374 ntTSL 57.57□□□□□ -1.23e-7■■■■■ 31.8
EXOSC5Q9NQT4 EHBP1-211ENST00000449820 539 ntTSL 57.31□□□□□ -1.243e-7■■■■■ 31.8
EXOSC5Q9NQT4 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.373e-7■■■■■ 31.8
EXOSC5Q9NQT4 EHBP1-207ENST00000426940 586 ntTSL 46.45□□□□□ -1.383e-7■■■■■ 31.8
EXOSC5Q9NQT4 EHBP1-208ENST00000427809 581 ntTSL 44.87□□□□□ -1.633e-7■■■■■ 31.8
EXOSC5Q9NQT4 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.683e-7■■■■■ 31.8
EXOSC5Q9NQT4 EHBP1-219ENST00000494958 1127 ntTSL 1 (best)4.51□□□□□ -1.693e-7■■■■■ 31.8
EXOSC5Q9NQT4 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.521e-6■■■■■ 31.8
EXOSC5Q9NQT4 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.531e-6■■■■■ 31.8
EXOSC5Q9NQT4 AC078845.1-201ENST00000445293 889 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.047e-7■■■■■ 31.7
EXOSC5Q9NQT4 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.997e-7■■■■■ 31.7
EXOSC5Q9NQT4 ACVR1-207ENST00000434821 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.771e-6■■■■■ 31.6
EXOSC5Q9NQT4 ACVR1-201ENST00000263640 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.061e-6■■■■■ 31.6
EXOSC5Q9NQT4 PRIM2-207ENST00000615550 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.335e-7■■■■■ 31.6
EXOSC5Q9NQT4 UGGT2-208ENST00000465196 610 ntTSL 34.87□□□□□ -1.632e-8■■■■■ 31.5
EXOSC5Q9NQT4 UGGT2-209ENST00000467305 910 ntTSL 34.25□□□□□ -1.732e-8■■■■■ 31.5
EXOSC5Q9NQT4 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.611e-6■■■■■ 31.5
EXOSC5Q9NQT4 DCTN4-213ENST00000521728 661 ntTSL 410.29□□□□□ -0.762e-7■■■■■ 31.4
EXOSC5Q9NQT4 GALK2-221ENST00000561014 797 ntTSL 36.2□□□□□ -1.428e-7■■■■■ 31.4
EXOSC5Q9NQT4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.992e-7■■■■■ 31.4
EXOSC5Q9NQT4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.572e-7■■■■■ 31.4
EXOSC5Q9NQT4 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.292e-7■■■■■ 31.4
EXOSC5Q9NQT4 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.322e-7■■■■■ 31.4
EXOSC5Q9NQT4 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.352e-7■■■■■ 31.4
EXOSC5Q9NQT4 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.472e-7■■■■■ 31.4
EXOSC5Q9NQT4 AFDN-207ENST00000400822 7593 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.82e-7■■■■■ 31.4
EXOSC5Q9NQT4 AFDN-204ENST00000366809 4839 ntTSL 1 (best)9.01□□□□□ -0.972e-7■■■■■ 31.4
EXOSC5Q9NQT4 GAB3-205ENST00000475685 298 ntTSL 53.31□□□□□ -1.889e-7■■■■■ 31.4
EXOSC5Q9NQT4 SUMF1-204ENST00000448413 3150 ntTSL 212.63□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 31.4
EXOSC5Q9NQT4 FCHO2-204ENST00000507345 726 ntTSL 512.29□□□□□ -0.442e-7■■■■■ 31.4
EXOSC5Q9NQT4 FCHO2-202ENST00000430046 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.912e-7■■■■■ 31.4
EXOSC5Q9NQT4 FCHO2-201ENST00000287761 1287 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.172e-7■■■■■ 31.4
EXOSC5Q9NQT4 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.582e-7■■■■■ 31.4
EXOSC5Q9NQT4 EXD3-212ENST00000491734 2176 ntTSL 1 (best)15.75■□□□□ 0.112e-8■■■■■ 31.4
EXOSC5Q9NQT4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.022e-8■■■■■ 31.4
EXOSC5Q9NQT4 STAU2-208ENST00000520872 560 ntTSL 314.79□□□□□ -0.042e-8■■■■■ 31.4
EXOSC5Q9NQT4 EXD3-210ENST00000487745 1992 ntTSL 214.73□□□□□ -0.052e-8■■■■■ 31.4
EXOSC5Q9NQT4 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.342e-8■■■■■ 31.4
EXOSC5Q9NQT4 STAU2-218ENST00000522061 564 ntTSL 46.4□□□□□ -1.382e-8■■■■■ 31.4
EXOSC5Q9NQT4 STAU2-206ENST00000519818 590 ntTSL 44.63□□□□□ -1.672e-8■■■■■ 31.4
EXOSC5Q9NQT4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.084e-15■■■■■ 31.4
EXOSC5Q9NQT4 SAMM50-203ENST00000474323 2368 ntTSL 212.77□□□□□ -0.374e-15■■■■■ 31.4
EXOSC5Q9NQT4 ATXN2-204ENST00000392645 2842 ntTSL 212.33□□□□□ -0.433e-7■■■■■ 31.4
EXOSC5Q9NQT4 ATXN2-218ENST00000549455 568 ntTSL 411.65□□□□□ -0.543e-7■■■■■ 31.4
EXOSC5Q9NQT4 SAMM50-205ENST00000493621 283 ntTSL 29.96□□□□□ -0.824e-15■■■■■ 31.4
EXOSC5Q9NQT4 SAMM50-206ENST00000494795 3248 ntTSL 28.89□□□□□ -0.994e-15■■■■■ 31.4
EXOSC5Q9NQT4 ATXN2-217ENST00000548492 556 ntTSL 45.41□□□□□ -1.543e-7■■■■■ 31.4
EXOSC5Q9NQT4 SAMM50-202ENST00000465768 169 ntTSL 33.76□□□□□ -1.814e-15■■■■■ 31.4
EXOSC5Q9NQT4 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.337e-7■■■■■ 31.3
EXOSC5Q9NQT4 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.517e-7■■■■■ 31.3
EXOSC5Q9NQT4 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.667e-7■■■■■ 31.3
EXOSC5Q9NQT4 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.727e-7■■■■■ 31.3
EXOSC5Q9NQT4 NBAS-208ENST00000442506 4391 ntTSL 1 (best)10.06□□□□□ -0.89e-7■■■■■ 31.3
EXOSC5Q9NQT4 ANAPC10-217ENST00000613466 1674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.781e-6■■■■■ 31.3
EXOSC5Q9NQT4 ANAPC10-218ENST00000641499 1538 nt8.13□□□□□ -1.111e-6■■■■■ 31.3
EXOSC5Q9NQT4 ANAPC10-204ENST00000502651 867 ntTSL 27.95□□□□□ -1.141e-6■■■■■ 31.3
EXOSC5Q9NQT4 ANAPC10-215ENST00000514390 794 ntTSL 37.12□□□□□ -1.271e-6■■■■■ 31.3
EXOSC5Q9NQT4 ANAPC10-209ENST00000507656 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.291e-6■■■■■ 31.3
EXOSC5Q9NQT4 ANAPC10-207ENST00000506851 471 ntTSL 36.72□□□□□ -1.331e-6■■■■■ 31.3
EXOSC5Q9NQT4 ANAPC10-214ENST00000513054 689 ntTSL 36.27□□□□□ -1.411e-6■■■■■ 31.3
EXOSC5Q9NQT4 ANAPC10-202ENST00000451299 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.431e-6■■■■■ 31.3
EXOSC5Q9NQT4 ANAPC10-211ENST00000510270 963 ntTSL 36.12□□□□□ -1.431e-6■■■■■ 31.3
Retrieved 100 of 8,799 protein–RNA pairs in 47 ms