Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NECTIN3Q9NQS3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECTIN3Q9NQS3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms