Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC52A3Q9NQ40 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms