Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FZD3Q9NPG1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FZD3Q9NPG1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FZD3Q9NPG1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FZD3Q9NPG1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FZD3Q9NPG1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FZD3Q9NPG1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FZD3Q9NPG1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FZD3Q9NPG1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FZD3Q9NPG1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FZD3Q9NPG1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FZD3Q9NPG1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FZD3Q9NPG1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FZD3Q9NPG1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FZD3Q9NPG1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FZD3Q9NPG1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FZD3Q9NPG1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FZD3Q9NPG1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FZD3Q9NPG1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FZD3Q9NPG1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FZD3Q9NPG1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FZD3Q9NPG1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FZD3Q9NPG1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FZD3Q9NPG1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms