Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP74

PALMD, Palmdelphin, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALMDQ9NP74 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PALMDQ9NP74 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PALMDQ9NP74 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PALMDQ9NP74 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PALMDQ9NP74 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PALMDQ9NP74 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PALMDQ9NP74 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PALMDQ9NP74 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PALMDQ9NP74 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PALMDQ9NP74 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PALMDQ9NP74 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PALMDQ9NP74 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PALMDQ9NP74 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PALMDQ9NP74 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PALMDQ9NP74 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PALMDQ9NP74 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PALMDQ9NP74 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PALMDQ9NP74 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PALMDQ9NP74 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PALMDQ9NP74 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PALMDQ9NP74 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PALMDQ9NP74 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PALMDQ9NP74 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PALMDQ9NP74 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PALMDQ9NP74 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PALMDQ9NP74 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PALMDQ9NP74 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PALMDQ9NP74 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PALMDQ9NP74 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PALMDQ9NP74 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PALMDQ9NP74 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PALMDQ9NP74 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PALMDQ9NP74 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PALMDQ9NP74 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PALMDQ9NP74 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PALMDQ9NP74 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PALMDQ9NP74 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PALMDQ9NP74 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PALMDQ9NP74 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PALMDQ9NP74 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PALMDQ9NP74 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PALMDQ9NP74 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PALMDQ9NP74 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PALMDQ9NP74 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms