Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU8

POLD4, DNA polymerase delta subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD4Q9HCU8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
POLD4Q9HCU8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLD4Q9HCU8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLD4Q9HCU8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLD4Q9HCU8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLD4Q9HCU8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
POLD4Q9HCU8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLD4Q9HCU8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLD4Q9HCU8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLD4Q9HCU8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLD4Q9HCU8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLD4Q9HCU8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLD4Q9HCU8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLD4Q9HCU8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLD4Q9HCU8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLD4Q9HCU8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLD4Q9HCU8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLD4Q9HCU8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLD4Q9HCU8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
POLD4Q9HCU8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLD4Q9HCU8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLD4Q9HCU8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLD4Q9HCU8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLD4Q9HCU8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLD4Q9HCU8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLD4Q9HCU8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLD4Q9HCU8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLD4Q9HCU8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLD4Q9HCU8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLD4Q9HCU8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLD4Q9HCU8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLD4Q9HCU8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
POLD4Q9HCU8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
POLD4Q9HCU8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLD4Q9HCU8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLD4Q9HCU8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLD4Q9HCU8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLD4Q9HCU8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
POLD4Q9HCU8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLD4Q9HCU8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLD4Q9HCU8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLD4Q9HCU8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
POLD4Q9HCU8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLD4Q9HCU8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLD4Q9HCU8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLD4Q9HCU8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLD4Q9HCU8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLD4Q9HCU8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLD4Q9HCU8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLD4Q9HCU8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLD4Q9HCU8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLD4Q9HCU8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLD4Q9HCU8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLD4Q9HCU8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLD4Q9HCU8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLD4Q9HCU8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLD4Q9HCU8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLD4Q9HCU8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLD4Q9HCU8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLD4Q9HCU8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLD4Q9HCU8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLD4Q9HCU8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLD4Q9HCU8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLD4Q9HCU8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLD4Q9HCU8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLD4Q9HCU8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLD4Q9HCU8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLD4Q9HCU8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLD4Q9HCU8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLD4Q9HCU8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLD4Q9HCU8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLD4Q9HCU8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLD4Q9HCU8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLD4Q9HCU8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
POLD4Q9HCU8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
POLD4Q9HCU8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLD4Q9HCU8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLD4Q9HCU8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLD4Q9HCU8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
POLD4Q9HCU8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLD4Q9HCU8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLD4Q9HCU8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLD4Q9HCU8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLD4Q9HCU8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLD4Q9HCU8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLD4Q9HCU8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLD4Q9HCU8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLD4Q9HCU8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLD4Q9HCU8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLD4Q9HCU8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLD4Q9HCU8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLD4Q9HCU8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLD4Q9HCU8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLD4Q9HCU8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLD4Q9HCU8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
POLD4Q9HCU8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLD4Q9HCU8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLD4Q9HCU8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
POLD4Q9HCU8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLD4Q9HCU8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms