Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCE7

SMURF1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1Q9HCE7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SMURF1Q9HCE7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192.6 ms