Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBU9

POPDC2, Popeye domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POPDC2Q9HBU9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
POPDC2Q9HBU9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POPDC2Q9HBU9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POPDC2Q9HBU9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
POPDC2Q9HBU9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POPDC2Q9HBU9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POPDC2Q9HBU9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POPDC2Q9HBU9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POPDC2Q9HBU9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POPDC2Q9HBU9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POPDC2Q9HBU9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POPDC2Q9HBU9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POPDC2Q9HBU9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POPDC2Q9HBU9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POPDC2Q9HBU9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POPDC2Q9HBU9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POPDC2Q9HBU9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POPDC2Q9HBU9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POPDC2Q9HBU9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POPDC2Q9HBU9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POPDC2Q9HBU9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POPDC2Q9HBU9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POPDC2Q9HBU9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms