Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBA0

TRPV4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV4Q9HBA0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPV4Q9HBA0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRPV4Q9HBA0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms