Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q2

COPS7B, COP9 signalosome complex subunit 7b, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7BQ9H9Q2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPS7BQ9H9Q2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPS7BQ9H9Q2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPS7BQ9H9Q2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPS7BQ9H9Q2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPS7BQ9H9Q2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPS7BQ9H9Q2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COPS7BQ9H9Q2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPS7BQ9H9Q2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COPS7BQ9H9Q2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPS7BQ9H9Q2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COPS7BQ9H9Q2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPS7BQ9H9Q2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPS7BQ9H9Q2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPS7BQ9H9Q2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPS7BQ9H9Q2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPS7BQ9H9Q2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPS7BQ9H9Q2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COPS7BQ9H9Q2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPS7BQ9H9Q2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPS7BQ9H9Q2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPS7BQ9H9Q2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPS7BQ9H9Q2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPS7BQ9H9Q2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPS7BQ9H9Q2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPS7BQ9H9Q2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPS7BQ9H9Q2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
COPS7BQ9H9Q2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPS7BQ9H9Q2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPS7BQ9H9Q2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPS7BQ9H9Q2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPS7BQ9H9Q2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPS7BQ9H9Q2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPS7BQ9H9Q2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPS7BQ9H9Q2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPS7BQ9H9Q2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPS7BQ9H9Q2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPS7BQ9H9Q2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPS7BQ9H9Q2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms