Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
PRKRIP1Q9H875 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PRKRIP1Q9H875 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PRKRIP1Q9H875 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PRKRIP1Q9H875 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PRKRIP1Q9H875 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PRKRIP1Q9H875 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRKRIP1Q9H875 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRKRIP1Q9H875 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRKRIP1Q9H875 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRKRIP1Q9H875 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRKRIP1Q9H875 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRKRIP1Q9H875 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRKRIP1Q9H875 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRKRIP1Q9H875 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRKRIP1Q9H875 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRKRIP1Q9H875 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRKRIP1Q9H875 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRKRIP1Q9H875 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRKRIP1Q9H875 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PRKRIP1Q9H875 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PRKRIP1Q9H875 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PRKRIP1Q9H875 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PRKRIP1Q9H875 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PRKRIP1Q9H875 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PRKRIP1Q9H875 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PRKRIP1Q9H875 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PRKRIP1Q9H875 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PRKRIP1Q9H875 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PRKRIP1Q9H875 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PRKRIP1Q9H875 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PRKRIP1Q9H875 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PRKRIP1Q9H875 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PRKRIP1Q9H875 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PRKRIP1Q9H875 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PRKRIP1Q9H875 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
PRKRIP1Q9H875 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PRKRIP1Q9H875 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PRKRIP1Q9H875 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PRKRIP1Q9H875 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PRKRIP1Q9H875 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PRKRIP1Q9H875 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PRKRIP1Q9H875 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PRKRIP1Q9H875 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PRKRIP1Q9H875 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRKRIP1Q9H875 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRKRIP1Q9H875 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRKRIP1Q9H875 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRKRIP1Q9H875 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRKRIP1Q9H875 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRKRIP1Q9H875 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRKRIP1Q9H875 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRKRIP1Q9H875 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRKRIP1Q9H875 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRKRIP1Q9H875 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRKRIP1Q9H875 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRKRIP1Q9H875 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRKRIP1Q9H875 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PRKRIP1Q9H875 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PRKRIP1Q9H875 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PRKRIP1Q9H875 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRKRIP1Q9H875 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRKRIP1Q9H875 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRKRIP1Q9H875 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
PRKRIP1Q9H875 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
PRKRIP1Q9H875 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRKRIP1Q9H875 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRKRIP1Q9H875 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRKRIP1Q9H875 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRKRIP1Q9H875 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRKRIP1Q9H875 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRKRIP1Q9H875 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRKRIP1Q9H875 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRKRIP1Q9H875 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRKRIP1Q9H875 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRKRIP1Q9H875 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRKRIP1Q9H875 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRKRIP1Q9H875 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRKRIP1Q9H875 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRKRIP1Q9H875 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRKRIP1Q9H875 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRKRIP1Q9H875 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRKRIP1Q9H875 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRKRIP1Q9H875 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRKRIP1Q9H875 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRKRIP1Q9H875 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRKRIP1Q9H875 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PRKRIP1Q9H875 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PRKRIP1Q9H875 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PRKRIP1Q9H875 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
PRKRIP1Q9H875 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRKRIP1Q9H875 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRKRIP1Q9H875 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRKRIP1Q9H875 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRKRIP1Q9H875 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRKRIP1Q9H875 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRKRIP1Q9H875 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PRKRIP1Q9H875 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PRKRIP1Q9H875 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PRKRIP1Q9H875 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms