Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7V2

SYNDIG1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1Q9H7V2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNDIG1Q9H7V2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SYNDIG1Q9H7V2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYNDIG1Q9H7V2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNDIG1Q9H7V2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNDIG1Q9H7V2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNDIG1Q9H7V2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNDIG1Q9H7V2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNDIG1Q9H7V2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNDIG1Q9H7V2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNDIG1Q9H7V2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNDIG1Q9H7V2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNDIG1Q9H7V2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNDIG1Q9H7V2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNDIG1Q9H7V2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNDIG1Q9H7V2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNDIG1Q9H7V2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNDIG1Q9H7V2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNDIG1Q9H7V2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNDIG1Q9H7V2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNDIG1Q9H7V2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNDIG1Q9H7V2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNDIG1Q9H7V2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNDIG1Q9H7V2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNDIG1Q9H7V2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNDIG1Q9H7V2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNDIG1Q9H7V2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNDIG1Q9H7V2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNDIG1Q9H7V2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNDIG1Q9H7V2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNDIG1Q9H7V2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNDIG1Q9H7V2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNDIG1Q9H7V2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNDIG1Q9H7V2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNDIG1Q9H7V2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNDIG1Q9H7V2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNDIG1Q9H7V2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNDIG1Q9H7V2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNDIG1Q9H7V2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNDIG1Q9H7V2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNDIG1Q9H7V2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNDIG1Q9H7V2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNDIG1Q9H7V2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms