Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6Y2

WDR55, WD repeat-containing protein 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR55Q9H6Y2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR55Q9H6Y2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 223.5 ms