Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2F9

CCDC68, Coiled-coil domain-containing protein 68, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC68Q9H2F9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC68Q9H2F9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms