Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LHX5Q9H2C1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LHX5Q9H2C1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LHX5Q9H2C1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LHX5Q9H2C1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LHX5Q9H2C1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LHX5Q9H2C1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LHX5Q9H2C1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LHX5Q9H2C1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LHX5Q9H2C1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LHX5Q9H2C1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LHX5Q9H2C1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LHX5Q9H2C1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LHX5Q9H2C1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LHX5Q9H2C1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LHX5Q9H2C1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LHX5Q9H2C1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LHX5Q9H2C1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LHX5Q9H2C1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LHX5Q9H2C1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LHX5Q9H2C1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LHX5Q9H2C1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LHX5Q9H2C1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LHX5Q9H2C1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LHX5Q9H2C1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LHX5Q9H2C1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LHX5Q9H2C1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LHX5Q9H2C1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LHX5Q9H2C1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LHX5Q9H2C1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LHX5Q9H2C1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LHX5Q9H2C1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LHX5Q9H2C1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LHX5Q9H2C1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LHX5Q9H2C1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LHX5Q9H2C1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LHX5Q9H2C1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LHX5Q9H2C1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LHX5Q9H2C1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LHX5Q9H2C1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LHX5Q9H2C1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LHX5Q9H2C1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LHX5Q9H2C1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LHX5Q9H2C1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LHX5Q9H2C1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LHX5Q9H2C1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LHX5Q9H2C1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LHX5Q9H2C1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LHX5Q9H2C1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LHX5Q9H2C1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LHX5Q9H2C1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LHX5Q9H2C1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LHX5Q9H2C1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LHX5Q9H2C1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LHX5Q9H2C1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LHX5Q9H2C1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LHX5Q9H2C1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LHX5Q9H2C1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LHX5Q9H2C1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LHX5Q9H2C1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LHX5Q9H2C1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LHX5Q9H2C1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LHX5Q9H2C1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LHX5Q9H2C1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LHX5Q9H2C1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LHX5Q9H2C1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LHX5Q9H2C1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LHX5Q9H2C1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LHX5Q9H2C1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms