Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP44Q9H0E7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP44Q9H0E7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
USP44Q9H0E7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP44Q9H0E7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP44Q9H0E7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP44Q9H0E7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP44Q9H0E7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP44Q9H0E7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP44Q9H0E7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
USP44Q9H0E7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP44Q9H0E7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP44Q9H0E7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
USP44Q9H0E7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP44Q9H0E7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP44Q9H0E7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP44Q9H0E7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP44Q9H0E7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP44Q9H0E7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP44Q9H0E7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP44Q9H0E7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP44Q9H0E7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP44Q9H0E7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP44Q9H0E7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP44Q9H0E7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP44Q9H0E7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP44Q9H0E7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP44Q9H0E7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP44Q9H0E7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP44Q9H0E7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP44Q9H0E7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP44Q9H0E7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP44Q9H0E7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP44Q9H0E7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP44Q9H0E7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP44Q9H0E7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP44Q9H0E7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
USP44Q9H0E7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP44Q9H0E7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP44Q9H0E7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP44Q9H0E7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP44Q9H0E7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP44Q9H0E7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP44Q9H0E7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP44Q9H0E7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP44Q9H0E7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP44Q9H0E7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP44Q9H0E7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP44Q9H0E7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP44Q9H0E7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP44Q9H0E7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP44Q9H0E7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP44Q9H0E7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP44Q9H0E7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
USP44Q9H0E7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms