Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NBPF3Q9H094 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF3Q9H094 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF3Q9H094 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF3Q9H094 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF3Q9H094 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF3Q9H094 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF3Q9H094 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF3Q9H094 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF3Q9H094 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF3Q9H094 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF3Q9H094 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF3Q9H094 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF3Q9H094 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF3Q9H094 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF3Q9H094 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NBPF3Q9H094 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NBPF3Q9H094 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NBPF3Q9H094 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NBPF3Q9H094 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NBPF3Q9H094 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NBPF3Q9H094 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NBPF3Q9H094 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NBPF3Q9H094 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NBPF3Q9H094 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NBPF3Q9H094 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NBPF3Q9H094 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NBPF3Q9H094 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NBPF3Q9H094 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NBPF3Q9H094 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NBPF3Q9H094 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NBPF3Q9H094 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NBPF3Q9H094 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NBPF3Q9H094 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NBPF3Q9H094 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NBPF3Q9H094 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NBPF3Q9H094 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NBPF3Q9H094 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NBPF3Q9H094 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NBPF3Q9H094 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NBPF3Q9H094 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NBPF3Q9H094 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NBPF3Q9H094 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NBPF3Q9H094 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NBPF3Q9H094 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NBPF3Q9H094 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NBPF3Q9H094 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NBPF3Q9H094 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NBPF3Q9H094 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NBPF3Q9H094 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NBPF3Q9H094 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NBPF3Q9H094 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NBPF3Q9H094 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NBPF3Q9H094 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NBPF3Q9H094 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NBPF3Q9H094 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NBPF3Q9H094 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NBPF3Q9H094 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NBPF3Q9H094 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NBPF3Q9H094 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NBPF3Q9H094 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NBPF3Q9H094 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NBPF3Q9H094 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NBPF3Q9H094 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NBPF3Q9H094 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NBPF3Q9H094 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NBPF3Q9H094 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NBPF3Q9H094 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NBPF3Q9H094 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NBPF3Q9H094 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NBPF3Q9H094 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NBPF3Q9H094 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NBPF3Q9H094 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NBPF3Q9H094 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NBPF3Q9H094 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NBPF3Q9H094 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NBPF3Q9H094 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NBPF3Q9H094 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NBPF3Q9H094 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NBPF3Q9H094 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms