Protein–RNA interactions for Protein: Q9H040

SPRTN, SprT-like domain-containing protein Spartan, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRTNQ9H040 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPRTNQ9H040 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SPRTNQ9H040 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms