Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC90BQ9GZT6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC90BQ9GZT6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 545.2 ms