Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLIRPQ9GZT3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SLIRPQ9GZT3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLIRPQ9GZT3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLIRPQ9GZT3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLIRPQ9GZT3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLIRPQ9GZT3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLIRPQ9GZT3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLIRPQ9GZT3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLIRPQ9GZT3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLIRPQ9GZT3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLIRPQ9GZT3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLIRPQ9GZT3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLIRPQ9GZT3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLIRPQ9GZT3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLIRPQ9GZT3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLIRPQ9GZT3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLIRPQ9GZT3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLIRPQ9GZT3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLIRPQ9GZT3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLIRPQ9GZT3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLIRPQ9GZT3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLIRPQ9GZT3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLIRPQ9GZT3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLIRPQ9GZT3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLIRPQ9GZT3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLIRPQ9GZT3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLIRPQ9GZT3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLIRPQ9GZT3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLIRPQ9GZT3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLIRPQ9GZT3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLIRPQ9GZT3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLIRPQ9GZT3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLIRPQ9GZT3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLIRPQ9GZT3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms