Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J1

B3GNT4, N-acetyllactosaminide beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3GNT4Q9C0J1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
B3GNT4Q9C0J1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
B3GNT4Q9C0J1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms