Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL4Q9C0H6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms