Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBE2OQ9C0C9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBE2OQ9C0C9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBE2OQ9C0C9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBE2OQ9C0C9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBE2OQ9C0C9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
UBE2OQ9C0C9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
UBE2OQ9C0C9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
UBE2OQ9C0C9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBE2OQ9C0C9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 233.9 ms