Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CIPCQ9C0C6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.5 ms