Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
INO80BQ9C086 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
INO80BQ9C086 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
INO80BQ9C086 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
INO80BQ9C086 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
INO80BQ9C086 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
INO80BQ9C086 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
INO80BQ9C086 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
INO80BQ9C086 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
INO80BQ9C086 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
INO80BQ9C086 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
INO80BQ9C086 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
INO80BQ9C086 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
INO80BQ9C086 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
INO80BQ9C086 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
INO80BQ9C086 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.4 ms