Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW4

TM6SF2, Transmembrane 6 superfamily member 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF2Q9BZW4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TM6SF2Q9BZW4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM6SF2Q9BZW4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms