Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTRT3Q9BYD9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms