Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms