Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
APOL6Q9BWW8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOL6Q9BWW8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOL6Q9BWW8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOL6Q9BWW8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOL6Q9BWW8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOL6Q9BWW8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOL6Q9BWW8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
APOL6Q9BWW8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOL6Q9BWW8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOL6Q9BWW8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOL6Q9BWW8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOL6Q9BWW8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOL6Q9BWW8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOL6Q9BWW8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOL6Q9BWW8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOL6Q9BWW8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOL6Q9BWW8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOL6Q9BWW8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOL6Q9BWW8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOL6Q9BWW8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOL6Q9BWW8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
APOL6Q9BWW8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOL6Q9BWW8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOL6Q9BWW8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOL6Q9BWW8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
APOL6Q9BWW8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOL6Q9BWW8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOL6Q9BWW8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOL6Q9BWW8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOL6Q9BWW8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOL6Q9BWW8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOL6Q9BWW8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOL6Q9BWW8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOL6Q9BWW8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOL6Q9BWW8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOL6Q9BWW8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOL6Q9BWW8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOL6Q9BWW8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOL6Q9BWW8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms