Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF2

TRAIP, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAIPQ9BWF2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAIPQ9BWF2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAIPQ9BWF2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAIPQ9BWF2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAIPQ9BWF2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAIPQ9BWF2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAIPQ9BWF2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAIPQ9BWF2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAIPQ9BWF2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAIPQ9BWF2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAIPQ9BWF2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAIPQ9BWF2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.5 ms