Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNDC11Q9BVV2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms