Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG8

KIFC3, Kinesin-like protein KIFC3, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC3Q9BVG8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
KIFC3Q9BVG8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms