Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC6

TMEM109, Transmembrane protein 109, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM109Q9BVC6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM109Q9BVC6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM109Q9BVC6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms