Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PI4K2AQ9BTU6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PI4K2AQ9BTU6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PI4K2AQ9BTU6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PI4K2AQ9BTU6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms