Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SYT11Q9BT88 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYT11Q9BT88 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYT11Q9BT88 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYT11Q9BT88 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYT11Q9BT88 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT11Q9BT88 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT11Q9BT88 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT11Q9BT88 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms