Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NDFIP1Q9BT67 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDFIP1Q9BT67 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms