Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSY4

CHCHD5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD5Q9BSY4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHCHD5Q9BSY4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms